拉伸自由能 / 剥离能
一句话价值
SMD + 伞状采样 + WHAM（占位）。
（占位）沿反应坐标计算 PMF 与自由能。
PMF/ΔG
输出
收敛/误差
关键量
窗口一致性
验收
关键图
技术亮点
我们为什么能把这类问题做得更稳、更快、更可复核
- 亮点 1：DFT校正、广适应度的建立含配位金属离子力场的脚本。
- 亮点 2：自适应的快速准备QM/MM输入文件的脚本。
- 亮点 3：我们对动力学和蛋白手性选择的深刻理解。
PMFUmbrellaWHAM
问题展开/收起
问题
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- （占位）剥离/拉伸自由能是多少？误差如何？
方法展开/收起
方法
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- SMD 初始路径
- 伞状窗口
- WHAM 重构
- 收敛检查
交付物展开/收起
交付物
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- PMF 曲线
- 窗口日志
- 复现脚本
验收口径展开/收起
验收口径
展开/收起
- 窗口一致性
- 收敛判据通过
- 可复核