含离子的分子对接与高通量

一句话价值
离子参与配位的分层筛选与再打分(占位)。

(占位)在含离子口袋/配位体系中进行高通量筛选,给出分层筛选策略与 Top hits。

10³ – 10⁶
规模
Top hits / 姿势簇
输出
再打分一致
验收
关键图
技术亮点
我们为什么能把这类问题做得更稳、更快、更可复核
  • 亮点 1:DFT校正、广适应度的建立含配位金属离子力场的脚本。
  • 亮点 2:自适应的快速准备QM/MM输入文件的脚本。
  • 亮点 3:我们对动力学和蛋白手性选择的深刻理解。
DockingHTVSIon-aware再打分
问题
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  • (占位)含离子参与时如何避免误报与姿势漂移?
方法
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  • 库准备
  • 离子口径/约束
  • 分层筛选
  • 重打分与聚类
  • Top 集验证
交付物
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  • Top hits 清单
  • 姿势簇与代表构象
  • 筛选口径与日志
验收口径
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  • 同口径复跑一致
  • Top 命中稳定
  • 输出可追溯