含离子的分子对接与高通量
一句话价值
离子参与配位的分层筛选与再打分(占位)。
(占位)在含离子口袋/配位体系中进行高通量筛选,给出分层筛选策略与 Top hits。
10³ – 10⁶
规模
Top hits / 姿势簇
输出
再打分一致
验收
关键图
技术亮点
我们为什么能把这类问题做得更稳、更快、更可复核
- 亮点 1:DFT校正、广适应度的建立含配位金属离子力场的脚本。
- 亮点 2:自适应的快速准备QM/MM输入文件的脚本。
- 亮点 3:我们对动力学和蛋白手性选择的深刻理解。
DockingHTVSIon-aware再打分
问题展开/收起
问题
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- (占位)含离子参与时如何避免误报与姿势漂移?
方法展开/收起
方法
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- 库准备
- 离子口径/约束
- 分层筛选
- 重打分与聚类
- Top 集验证
交付物展开/收起
交付物
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- Top hits 清单
- 姿势簇与代表构象
- 筛选口径与日志
验收口径展开/收起
验收口径
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- 同口径复跑一致
- Top 命中稳定
- 输出可追溯
